# PCR > Réaction en chaîne par polymérase. Méthode moléculaire de détection d'ADN ou d'ARN viral. Pour les hantavirus : sensibilité ~92 %, spécificité 100 %, résultat en quelques heures. Source canonique : https://hantatracker.fr/glossary/pcr/ **Alias** : RT-PCR, RT-qPCR, test PCR, polymerase chain reaction La **PCR** (réaction en chaîne par polymérase, *polymerase chain reaction* en anglais) est une technique de biologie moléculaire qui amplifie un fragment d'ADN ou d'ARN cible des millions de fois. Pour les virus à ARN comme l'hantavirus, on utilise une **RT-PCR** (reverse-transcription PCR) qui transcrit d'abord l'ARN viral en ADN. La PCR est l'outil de choix pour le diagnostic précoce des hantaviroses : c'est par PCR que le virus Andes a été identifié chez les patients du MV Hondius le 3 mai 2026. ## Principe technique ### Amplification exponentielle La PCR repose sur des cycles thermiques qui dénaturent l'ADN, fixent des amorces oligonucléotidiques spécifiques de la séquence cible, puis polymérisent un nouveau brin. À chaque cycle, le nombre de copies double. En 30 à 40 cycles, une seule copie d'origine peut produire jusqu'à un milliard de copies, rendant la cible détectable. ### RT-PCR pour les virus à ARN Les hantavirus ont un génome à ARN. La RT-PCR ajoute une étape préalable de **reverse transcription** : l'ARN viral est transcrit en ADN complémentaire (cDNA) par une enzyme reverse transcriptase, puis amplifié comme une PCR classique. La RT-qPCR (« quantitative ») mesure en temps réel la quantité d'ADN amplifié à chaque cycle, ce qui permet à la fois la détection et l'estimation de la charge virale dans l'échantillon. ## Performance pour le diagnostic des hantaviroses ### Sensibilité et spécificité Une étude de référence publiée dans *PLOS Neglected Tropical Diseases* a évalué la performance d'une RT-qPCR développée pour le diagnostic du syndrome pulmonaire à hantavirus en Amérique du Sud : - **Sensibilité clinique** : 92,5 % - **Spécificité clinique** : 100 % - **Précision globale** : 97,6 % - **Limite de détection analytique** : 0,9 copie d'ARN viral par microlitre Ces performances font de la RT-qPCR le test de référence pour la confirmation diagnostique précoce, en particulier en contexte d'épidémie. ### Fenêtre de détection La charge virale dans le sang est maximale dans les **5 premiers jours de symptômes**, avec une détection possible jusqu'au **11e jour environ**. Au-delà, la sensibilité de la PCR diminue rapidement et la sérologie (recherche d'IgM puis d'IgG) prend le relais pour le diagnostic et le suivi épidémiologique. ## Application au MV Hondius ### Identification du pathogène Pour l'épisode MV Hondius, c'est la PCR qui a permis le **3 mai 2026** l'identification du virus Andes chez les patients à bord. Les échantillons prélevés lors des évacuations sanitaires (Sainte-Hélène, Afrique du Sud) ont été acheminés vers des laboratoires de référence virologique européens pour confirmation. L'identification rapide a déclenché les mesures de surveillance internationale et la notification d'épidémie de l'OMS. ### Surveillance des contacts Les passagers et contacts identifiés peuvent bénéficier d'une RT-PCR à l'apparition de tout symptôme évocateur durant la période de surveillance de 42 jours. Un test négatif précoce ne dispense pas de la surveillance jusqu'à la fin de la période, car l'incubation peut atteindre 6 semaines. ## Limites et précautions ### Faux positifs et faux négatifs Aucun test n'est parfait. Une RT-qPCR peut être négative très tôt (avant la phase virémique), pendant la phase de récupération, ou en cas de prélèvement de mauvaise qualité. Inversement, des contaminations en laboratoire peuvent générer de rares faux positifs. La décision médicale s'appuie toujours sur l'association du résultat PCR avec le contexte clinique et épidémiologique. ### Logistique de transport Les échantillons potentiellement infectieux sont transportés en triple emballage **UN3373** (« biological substance, category B ») vers les laboratoires de référence. Cette logistique introduit des délais qu'il faut anticiper dans la prise en charge — le résultat est typiquement disponible en 24 à 48 heures plutôt qu'en quelques heures.